nf-core / rnaseq
rnaseq
RNA sequencing analysis pipeline using STAR, RSEM, HISAT2 or Salmon with gene/isoform counts and extensive quality control.
rnaseq 是用 Nextflow 编写的自动化工具，用于流程自动化编排。
目前累计 1.4k star、905 fork，主要语言为 Nextflow，项目始于 2018 年，采用 MIT 许可。最近状态：近一个月有提交。适合：想减少重复劳动的团队。
中文介绍优先采用本站人工维护条目；无维护条目时依据 GitHub 公开字段（语言、主题、星标、提交时间）自动生成，未经项目方确认，不构成选型结论。nf-core/rnaseq 是一个以 Nextflow 为主的开源项目，目前累计 1.4k star、905 fork，近 30 天内有提交。主要方向：nextflow、nf-core、pipeline、rna、rna-seq、工作流。
依据 GitHub 公开字段（语言、主题、星标、提交时间）自动生成，未经人工逐项核实。